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【会议回顾】单细胞纳米孔长读长测序技术研讨会-精彩回顾

2023-12-08

12月1日-2日,由浙江大学农生环测试中心主办,杭州37000cm威尼斯技术有限公司与Oxford NanoporeTechnologies联合承办的“单细胞纳米孔长读长测序技术研讨会” 圆满落幕。


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本次研讨会上,来自单细胞不同研究领域的科学家们进行了专题报告,分享了他们利用纳米孔测序进行单细胞相关研究的成果,内容涵盖了空间组学、癌症研究、微生物、人类基因组、创新方法学研究等多个应用领域,本次会议共吸引了一百五十余位专家,共同探讨学习单细胞纳米孔测序技术应用的现状与未来。



精彩回顾

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郑绍建教授致辞

浙江大学生命科学学院学部副部长

浙江省植物生理与植物分子生物学学会理事长


郑绍建教授为大会做开幕致辞。郑绍建教授对杭州37000cm威尼斯技术有限公司在生命科学领域新技术的引进与推广方面做出的贡献给予了高度的评价,希望通过本次研讨会,推进单细胞测序技术发展,促进纳米孔测序技术实际应用,提升学术及数据分析水平。



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浙江大学农生环测试中心副主任王华教授

37000cm威尼斯董事长施觉亮先生

一起听取大会报告



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从单细胞到空间单细胞全长转录组测序

在癌症耐药研究中的应用

田鲁亦研究员

广州国家实验室


田鲁亦研究员系统性地介绍了从单细胞到空间单细胞领域的基础技术路线,分享了其团队基于单细胞纳米孔测序技术开发的分析工具Flames以及通过纳米孔全长转录组测序技术发现癌症耐药相关突变以及机制研究,同时分享了空间转录组测序的相关案例。



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纳米孔与单细胞结合带来的机会与挑战

 陈磊研究员

上海交通大学医学附属仁济医院


陈磊研究员详细介绍了与传统测序技术相比较,纳米孔长读长测序技术为单细胞测序带来了新的可能。报告指出,纳米孔测序技术结合单细胞能够鉴定更多的转录物/转录物异构体,更精细的聚类,更准确的区分转录物和假基因等。



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基于Oxford Nanopore平台的单细胞全长转录组测序

严舒琪女士

牛津纳米孔技术应用专家 


严舒琪女士首先介绍了纳米孔长读长测序技术在单细胞以及空间组学研究领域可以揭示在常规短读长测序技术中丢失的新维度信息,包含全长转录本结构、可变剪切、融合基因等,同时严舒琪女士系统性回顾了纳米孔测序在单细胞领域以及空间组学的应用研究,介绍了单细胞平台加纳米孔测序平台加分析的整体解决方案。




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单细胞全长转录组解析肿瘤细胞异质性

龚亮研究员

浙江大学良渚实验室


龚亮研究员的报告详细介绍了前沿的纳米孔测序技术结合单细胞测序,相对二代短读长测序技术可以更好地对肿瘤细胞异质性进行解析,尤其通过全长RNA测序可以提供更高分辨率的细胞亚群鉴定,可以更好地鉴定新基因或者新转录本。




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高通量测序技术的应用和挑战

毛伟华教授

浙江大学农生环测试中心


毛伟华教授系统性介绍了测序技术的发展历程以及浙大农生环分析测试中心的测序平台,其中重点介绍了纳米孔测序技术超长读长、直接测序、实时测序等技术优势,以及利用浙大农生环测序中心纳米孔测序平台帮助浙大师生合作完成的科研成果,包括在微生物基因组测序和植物全长CircRNA测序等领域的应用案例。



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MobiNova®跨平台、多物种单细胞多组学解决方案

王梦心女士

墨卓生物高级产品经理


王梦心女士介绍到,墨卓MobiNova®-100单细胞测序建库系统,基于分子标签(barcode)的单细胞识别,利用独家专利的标签和油包水技术,可对多种样本自动完成单细胞分离、细胞裂解、核酸捕获,是高质量、端到端的高通量单细胞测序建库系统。




数据实操

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纳米孔测序以其“超长读长、直接DNA/RNA测序、实时测序、操作简单”等优势受到科研与临床等各研究领域专家的高度关注。但是数据分析一直是很多科学家较为关心的话题,本届单细胞研讨会特别联合及智(苏州)医学技术有限公司的专业生信团队,开展单细胞纳米孔测序数据分析实操培训班,带领大家完成了二代单细胞与三代全长转录本合并分析,此次培训班包含拟时序、组间差异、富集分析、转录本关联膜蛋白、分泌蛋白、转录因子等一系列分析,同时并就单细胞全长转录本数据特点及分析难点进行了全面透彻的解析。


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单细胞全长转录测序分析技术测评

 陈磊研究员

上海交通大学医学附属仁济医院 




单细胞全长测序:cDNA水平的单细胞遗传变异研究

 程小涛总经理

及智(苏州)医学技术有限公司



基于单细胞全长转录组的抗体、核酸药物研发策略

梁辉常务副所长

苏州思萃免疫技术研究所



生信培训现场学员照片



至此,本次研讨会顺利结束,希望通过本次研讨会,为大家带来最热门、最前沿的单细胞研究,推进纳米孔长读长测序在单细胞领域的应用,期待未来与各位专家学者更多的交流与合作。


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合影留念





37000cm威尼斯集团创立于1997年7月,在生命科学和大健康领域中致力于引进、推广国内外先进技术与产品,是一家集技术开发与推广、产品销售、售后服务等为一体的综合发展的高科技公司,与全球最前沿的著名企业如Bio-Rad、Danaher集团、LONZA、Waters、Nanopore、Abcam、Nanolive、3D Histech、杭州柏熠等建立了良好的合作关系。总部设立于浙江杭州,在江苏、安徽、江西、福建、湖北等地设立了分公司或办事处。


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